RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 HPSE2Q8WWQ2 592 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf79Q96F83 325 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SSUH2Q9Y2M2 353 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 F10P00742 488 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM5P06731 702 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR13C7P0DN81 318 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PDZK1IP1Q13113 114 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR8B8Q15620 311 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR8G2PQ6IF36 304 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CDH26Q8IXH8 852 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR2AK2Q8NG84 335 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 MITD1Q8WV92 249 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM4Q8WVI0 70 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 FAM234AQ9H0X4 552 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHA2Q9HB19 425 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD61A6NGH8 418 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL10P02778 98 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 MYOGP15173 224 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 RUNX2Q13950 521 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLC10A1Q14973 349 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 BHLHE23Q8NDY6 225 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR5M1Q8NGP8 315 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OXGR1Q96P68 337 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC30A6NM36 301 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 IL10RAQ13651 578 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF75AQ96N20 296 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GRPP07492 148 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EPXP11678 715 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM240Q5SV17 173 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OR2G2Q8NGZ5 317 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NT5CQ8TCD5 201 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPRX4Q96LA9 322 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A6YYD5 115 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EFSO43281 561 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OR4E1P0C645 316 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RPA2P15927 270 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EN2P19622 333 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALNT1Q00973 533 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf87Q8N0U7 546 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TMED6Q8WW62 240 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WZY1 265 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TUBAL3A6NHL2 446 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CD3DP04234 171 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf73Q69YU5 71 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM5Q6NVV9 412 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FRG2CA6NGY1 282 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CTSLP07711 333 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC190Q86UF4 302 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL6Q8N531 539 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TSLPQ969D9 159 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ATF6BQ99941 703 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RHNO1Q9BSD3 238 aa19.2■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EDDM3AQ14507 147 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF724A8MTY0 619 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CBR1P16152 277 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SPNS2Q8IVW8 549 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PTDSS2Q9BVG9 487 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf49Q9H741 205 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 LANCL2Q9NS86 450 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF680Q8NEM1 530 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CCL4L1Q8NHW4 92 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OCEL1Q9H607 264 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PTAFRP25105 342 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NPBWR1P48145 328 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPRX1Q96LB2 322 aa19.19■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CROCCQ5TZA2 2017 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PNR3 127 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FCGR2CP31995 323 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MMP15P51511 669 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2CBP62714 309 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2CAP67775 309 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SHBQ15464 509 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NKG7Q16617 165 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KIRREL2Q6UWL6 708 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KMT5CQ86Y97 462 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf40Q8WZ69 217 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 DECR2Q9NUI1 292 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A13Q9Y226 551 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 XRCC2O43543 280 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NXPH3O95157 252 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RNF4P78317 190 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TAF9Q16594 264 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms