RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 POU3F4P49335 361 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 RAB25P57735 213 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 SERPINA12Q8IW75 414 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 OR52I2Q8NH67 350 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 IP6K3Q96PC2 410 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 CNR1P21554 472 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 HSD11B1P28845 292 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 GRB2P62993 217 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 ZFP69Q49AA0 526 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 TCTE3Q8IZS6 198 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM123Q8N131 208 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 SLC25A28Q96A46 364 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 CACNG6Q9BXT2 260 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 PIEZO1Q92508 2521 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD9-201ENST00000249499 C7orf66A4D0T2 115 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 LINC01387J3KSC0 135 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 CTSSP25774 331 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 HTR2CP28335 458 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf100Q5SVJ3 147 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 PTX4Q96A99 478 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 NELFAQ9H3P2 528 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 P2RY10O00398 339 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 TNFSF11O14788 317 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 CTAG2O75638 210 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 MSR1P21757 451 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 CDAP32320 146 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN6P56747 220 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ZFP64Q9NPA5 681 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 NUDT15Q9NV35 164 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 A0A0A6YYH2 397 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 A0A0G2JMM0 328 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PPB8 328 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1W2PRS3 328 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 GGT3PA6NGU5 568 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 A6NJ64 397 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 SYT7O43581 403 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 TAF13Q15543 124 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 PLPP7Q8NBV4 271 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 SCMH1Q96GD3 660 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 STMN3Q9NZ72 180 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ABI3Q9P2A4 366 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 POU2F3Q9UKI9 436 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 RCE1Q9Y256 329 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 PCSK5Q92824 1860 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 CDK2AP1O14519 115 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ENPP1P22413 925 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 GIFP27352 417 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 CASRP41180 1078 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 LYPD6Q86Y78 171 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 PHF21AQ96BD5 680 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 UCN2Q96RP3 112 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 HES3Q5TGS1 186 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 LUZP2Q86TE4 346 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 GGNQ86UU5 652 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 OR56B4Q8NH76 319 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 HRASLSQ9HDD0 168 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ING3Q9NXR8 418 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 EMC3Q9P0I2 261 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 A0A1B0GVI7 797 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 CIB4A0PJX0 185 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 DHHO43323 396 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 GABRA1P14867 456 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 SDK2Q58EX2 2172 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF529Q6P280 563 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD9-201ENST00000249499 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms