RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CD247P20963 164 aa13.55□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 STOMP27105 288 aa13.55□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CRYBA2P53672 197 aa13.55□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF74Q16587 644 aa13.55□□□□□ -0.24
SPCS1-201ENST00000233025 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 C1orf21Q9H246 121 aa13.54□□□□□ -0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZER1Q7Z7L7 766 aa13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC18Q8N456 261 aa13.51□□□□□ -0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 OR4F17Q8NGA8 305 aa13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TSPEARQ8WU66 669 aa13.51□□□□□ -0.25
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