RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	TAPBP	O15533	448 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	GPR32	O75388	356 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	FPR2	P25090	351 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	CD200	P41217	278 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	SERF2	P84101	59 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	HMGB4	Q8WW32	186 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	INIP	Q9NRY2	104 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	NME2P1	O60361	137 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	TNFSF15	O95150	251 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	VEGFB	P49765	207 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	PRRX1	P54821	245 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ABHD4	Q8TB40	342 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35	2e-9	■□□□□ 8.9
MDM4-215	ENST00000614459	SFRP2	Q96HF1	295 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	DOK2	O60496	412 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	IL10RA	Q13651	578 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	GRB7	Q14451	532 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	CT83	Q5H943	113 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	FCRLA	Q7L513	359 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	BCO2	Q9BYV7	579 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	USP3	Q9Y6I4	520 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	CORT	O00230	105 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	GP1BA	P07359	652 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	HOXB5	P09067	269 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	EGR3	Q06889	387 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	SGCA	Q16586	387 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	UNC50	Q53HI1	259 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	CHST11	Q9NPF2	352 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	DMAC2	Q9NW81	257 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	PIR	O00625	290 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	GPR37L1	O60883	481 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	MYOG	P15173	224 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	GPX3	P22352	226 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	WNT7B	P56706	349 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	RELT	Q969Z4	430 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM19	Q96HH6	336 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MDM4-215	ENST00000614459	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	ABO	P16442	354 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	PIGF	Q07326	219 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459		G3V2L1	256 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	NDUFB6	O95139	128 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	UTS2	O95399	124 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF17	P17021	662 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	NEURL2	Q9BR09	285 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459		M0QYG6	137 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	LDB2	O43679	373 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	TSPAN13	O95857	204 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	OR5AL1	P0C617	328 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	PRF1	P14222	555 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	SLC35B1	P78383	322 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	SHC2	P98077	582 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MDM4-215	ENST00000614459	FCRL6	Q6DN72	434 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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