RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 EXT1Q16394 746 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PLPPR5Q32ZL2 321 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CMTM4Q8IZR5 234 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD17B8Q92506 261 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK17Q96T54 332 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTR6Q9GZN1 396 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM172BPA6NC97 362 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 GABARAPH6UMI1 98 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD9O00233 223 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 LANCL1O43813 399 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ARSBP15848 533 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF1P41567 113 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXF1Q12946 379 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFA5Q16718 116 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 MEP1BQ16820 701 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52N5Q8NH56 324 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HAVCR1Q96D42 359 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 MED11Q9P086 117 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 EMC3Q9P0I2 261 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WZY1 265 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 C7orf66A4D0T2 115 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 YES1P07947 543 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CELA2AP08217 269 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 KIR3DL2P43630 455 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 MADCAM1Q13477 382 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 TOMM20Q15388 145 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT9Q86SS6 491 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ITFG2Q969R8 447 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NIPAL2Q9H841 368 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL7AQ9H8H3 244 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC17A5Q9NRA2 495 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXJ3Q9UPW0 622 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PLGP00747 810 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CD37P11049 281 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF823P16415 610 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 BTCP35070 178 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ART1P52961 327 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM8P78325 824 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HSF1Q00613 529 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 OR7A5Q15622 319 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR38Q5JTN6 314 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35D2Q76EJ3 337 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT77Q7Z794 578 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF227Q86WZ6 799 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2J2Q8N2K1 259 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 FADS6Q8N9I5 356 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC26A10Q8NG04 563 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 M1APQ8TC57 530 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 UBASH3BQ8TF42 649 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HAS2Q92819 552 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A38Q96DW6 304 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 LIN7BQ9HAP6 207 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ING3Q9NXR8 418 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SPARCP09486 303 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTT2BP0CG30 244 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 FSTP19883 344 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 DCTDP32321 178 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 BCL2A1Q16548 175 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf33Q6P1S2 294 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CATSPERDQ86XM0 798 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2M3Q8NG83 312 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD6Q9BV23 337 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5V1Q9UGF6 321 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 STEAP1Q9UHE8 339 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA2P2A6NMY6 339 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 HES5Q5TA89 166 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 OPN5Q6U736 354 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 DNM1P46Q6ZS02 220 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NOXA1Q86UR1 476 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM106AQ96A25 262 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 RASL10BQ96S79 203 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 AMELYQ99218 206 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNT9Q9HCQ5 603 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G3Q9NZ20 509 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A6Q9Y289 635 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms