RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBCCD1Q9NVR7 557 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM166BA8MTA8 275 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELK1P19419 428 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPR2P20594 1047 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFAP77Q6ZQR2 320 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRTM1Q86UE6 522 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51A4Q8NGJ6 313 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM106AQ96A25 262 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 NELFAQ9H3P2 528 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCF7L1Q9HCS4 588 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 CENPMQ9NSP4 180 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR52A1Q9UKL2 312 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 EMC9Q9Y3B6 208 aa25.14■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSR1P21757 451 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SOX2P48431 317 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARG2P78540 354 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 FCRLAQ7L513 359 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A16Q86VW1 577 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM178AQ8NBL3 297 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ROBO4Q8WZ75 1007 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ORAI1Q96D31 301 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM206AQ9NX38 181 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 V9GY05 133 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFITM5A6NNB3 132 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF878C9JN71 531 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 AIPO00170 330 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFA1P59665 94 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFA3P59666 94 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPIAP62937 165 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC20Q12834 499 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 BAK1Q16611 211 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF766Q5HY98 468 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SETD6Q8TBK2 473 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPP1R14AQ96A00 147 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 NABP1Q96AH0 204 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRI1Q9BV20 369 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLR1DQ9Y2S0 133 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGEB3O15480 346 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTTG1O95997 202 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACHEP22303 614 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TNFSF10P50591 281 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSMD7P51665 324 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 UCNP55089 124 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR8H2Q8N162 312 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM45BQ96B21 275 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A18Q9H1K4 315 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC6A15Q9H2J7 730 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 C14orf119Q9NWQ9 140 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASH2LQ9UBL3 628 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPATA2Q9UM82 520 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC43A1O75387 559 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL7P13232 177 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFPP27918 469 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 NTF4P34130 210 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM244Q5VVB8 128 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLHL24Q6TFL4 600 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM109AQ8N4B1 249 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEIOBQ8N635 442 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SAMD12Q8N8I0 201 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 POC5Q8NA72 575 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ULBP2Q9BZM5 246 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 HHLA2Q9UM44 414 aa25.11■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTLL8A6PVC2 850 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACTL6AO96019 429 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAHP00439 452 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 APOA1P02647 267 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADRA2CP18825 462 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMPRSS3P57727 454 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST1H3AP68431 136 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ODF4Q2M2E3 257 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST2H3AQ71DI3 136 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ASB5Q8WWX0 329 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNJ15Q99712 375 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF416Q9BWM5 594 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM25AB3EWG3 89 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM25CB3EWG5 89 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM25GB3EWG6 89 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTSSP25774 331 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF84P51523 738 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC10A1Q14973 349 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 AAED1Q7RTV5 226 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms