RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-215ENST00000476784 OSMP13725 252 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 RBP2P50120 134 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 BTG2P78543 158 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 CSF3RQ99062 836 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.1□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 RAB1AP62820 205 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 GRINAQ7Z429 371 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ALG12Q9BV10 488 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 NOX4Q9NPH5 578 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 CTSFQ9UBX1 484 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 HSPB2A8KAH6 182 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 NRASP01111 189 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 CDK1P06493 297 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ST6GAL1P15907 406 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 TAS2R45P59539 299 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 HSPB2Q16082 182 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ZNF404Q494X3 552 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR56B4Q8NH76 319 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 BLNKQ8WV28 456 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 CMBLQ96DG6 245 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 P2RX4Q99571 388 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR6C76A6NM76 312 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 M0R082 166 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ICOSLGO75144 302 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 CSF1P09603 554 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OPRM1P35372 400 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 MAP2K6P52564 334 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 AVPI1Q5T686 147 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 MRAP2Q96G30 205 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 RANBP9Q96S59 729 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ATG101Q9BSB4 218 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ZNF195O14628 629 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 SLC35E2P0CK97 266 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 IAPPP10997 89 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 NAGAP17050 411 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 KIAA1024LP59773 190 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 SELENBP1Q13228 472 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR4F5Q8NH21 305 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR4C3Q8NH37 302 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 RASD2Q96D21 266 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR2A14Q96R47 310 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 OR4F4Q96R69 305 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 MGLLQ99685 303 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 K7ESF4 209 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 MAGEB1P43366 347 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 EMP1P54849 157 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 DNAJB13P59910 316 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ZXDAP98168 799 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 COQ5Q5HYK3 327 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 DRAM2Q6UX65 266 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 NPWQ8N729 165 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.09□□□□□ -1.43
TTC3-215ENST00000476784 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 CAPNS1P04632 268 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 COL9A1P20849 921 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 FDXRP22570 491 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 ARNTP27540 789 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 BSGP35613 385 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 COL19A1Q14993 1142 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.09□□□□□ -1.44
TTC3-215ENST00000476784 MDGA2Q7Z553 956 aa6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms