RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 KRT14P02533 472 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TFPTP0C1Z6 253 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 HTR5AP47898 357 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 INSL3P51460 131 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 PPP1CBP62140 327 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 KRT72Q14CN4 511 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 GPR68Q15743 365 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 HAGHQ16775 308 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 NCR3LG1Q68D85 454 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TMEM53Q6P2H8 277 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 MOGAT3Q86VF5 341 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TMEM219Q86XT9 240 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 MFSD8Q8NHS3 518 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 LYZL4Q96KX0 146 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 SH3GL3Q99963 347 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 WACQ9BTA9 647 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ULBP2Q9BZM5 246 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TRIM5Q9C035 493 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TMEM38BQ9NVV0 291 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ONECUT1Q9UBC0 465 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 NUPR2A6NF83 97 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 MS4A18H0YCH9 400 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CCL24O00175 119 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 MANBAO00462 879 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 DVL1O14640 695 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ADAM20O43506 726 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TBX19O60806 448 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 GUSBP08236 651 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 STOMP27105 288 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 APLNRP35414 380 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 FNTAP49354 379 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 NHLH2Q02577 135 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 BNIP2Q12982 314 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 SMU1Q2TAY7 513 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ZNF260Q3ZCT1 412 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 SLC36A2Q495M3 483 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 PLA1AQ53H76 456 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CARD17Q5XLA6 110 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ARL9Q6T311 187 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 WDR88Q6ZMY6 472 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 OLIG3Q7RTU3 272 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ARMC8Q8IUR7 673 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 SYCE1Q8N0S2 351 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 FGFRL1Q8N441 504 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CLHC1Q8NHS4 586 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ZFP28Q8NHY6 868 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CHMP6Q96FZ7 201 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 DUX3Q96PT4 197 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 EMC6Q9BV81 110 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 KAAG1Q9UBP8 84 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 DNAJB11Q9UBS4 358 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 MKLN1Q9UL63 735 aa2.55□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TNCP24821 2201 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 A0A1B0GWJ7 208 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ELOVL7A1L3X0 281 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CLDN24A6NM45 220 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 NDUFA2O43678 99 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ENTPD5O75356 428 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 STX11O75558 287 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 HLA-DOBP13765 273 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 GP9P14770 177 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 CCNOP22674 350 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 KCNJ10P78508 379 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 FHL3Q13643 280 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 C1DQ13901 141 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 KCNJ8Q15842 424 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 GSTA3Q16772 222 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 FAM27D1Q5T7N8 215 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ASPHD1Q5U4P2 390 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 TTC27Q6P3X3 843 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 PLBD1Q6P4A8 553 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 OSR2Q8N2R0 312 aa2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PMS1-215ENST00000447232 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa2.54□□□□□ -2
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