RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384199.1

RNU6-1024P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1024, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1024P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ILKQ13418 452 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DGCR6Q14129 220 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TBRG1Q3YBR2 411 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TCEAL6Q6IPX3 200 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 Q6ZQY7 126 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR10P1Q8NGE3 313 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR9G1Q8NH87 305 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NCOA7Q8NI08 942 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RNF170Q96K19 258 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UGT2B28Q9BY64 529 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KLHL4Q9C0H6 718 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DEFB127Q9H1M4 99 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SIAEQ9HAT2 523 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 AS3MTQ9HBK9 375 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NARFQ9UHQ1 456 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SERPINB13Q9UIV8 391 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 COQ4Q9Y3A0 265 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PRKAB1Q9Y478 270 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FADS3Q9Y5Q0 445 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 WDR62O43379 1518 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FMN2Q9NZ56 1722 aa-4.01□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PLXNA2O75051 1894 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UGT2B11O75310 529 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NDST3O95803 873 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RPN2P04844 631 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GOLGA6DP0CG33 693 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NNMTP40261 264 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RARSP54136 660 aaKnown RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MTPNP58546 118 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ABRQ12979 859 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SCARB2Q14108 478 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ITIH4Q14624 930 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 POU2AF1Q16633 256 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ACTBL2Q562R1 376 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC26A11Q86WA9 606 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PAQR7Q86WK9 346 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TCEAL8Q8IYN2 117 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MSANTD4Q8NCY6 345 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM71CQ8NEG0 241 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CD200R1Q8TD46 325 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NELFBQ8WX92 580 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC7A6Q92536 515 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PTX4Q96A99 478 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SUCLG2Q96I99 432 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM68Q96MH6 324 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CATSPER2Q96P56 530 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OXGR1Q96P68 337 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TSSK3Q96PN8 268 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C11orf70Q9BRQ4 267 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MS4A8Q9BY19 250 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM60Q9H2L4 133 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 VCX3BQ9H321 246 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MFSD1Q9H3U5 465 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KCNK15Q9H427 330 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 WDR76Q9H967 626 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ARMT1Q9H993 441 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 Q9HAA7 133 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SACM1LQ9NTJ5 587 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CFAP45Q9UL16 551 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SCML1Q9UN30 329 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CLIC4Q9Y696 253 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 WASHC2AQ641Q2 1341 aa-4.02□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MGAQ8IWI9 3026 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 A0A0D9SFI3 127 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 A0A1B0GUS0 222 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 A0A1W2PPL8 197 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR5H1A6NKK0 313 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C11orf98E9PRG8 122 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCL24O00175 119 aa-4.03□□□□□ -3.05
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TSPAN4O14817 238 aa-4.03□□□□□ -3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms