RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ROM1Q03395 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZMYND11Q15326 602 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ARSKQ6UWY0 536 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GRINAQ7Z429 371 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 SEC22AQ96IW7 307 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SPACA5Q96QH8 159 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C12orf10Q9HB07 376 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 CKLFQ9UBR5 152 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 VSIG4Q9Y279 399 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 R4GMQ9 66 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MS4A18H0YCH9 400 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CYB5AP00167 134 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 PTGS2P35354 604 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GNALP38405 381 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGDIBP52566 201 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SCAND1P57086 179 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GLO1Q04760 184 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DHRS2Q13268 280 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FJX1Q86VR8 437 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FAM219AQ8IW50 185 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CDH26Q8IXH8 852 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BEST3Q8N1M1 668 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CHST4Q8NCG5 386 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 ST7LQ8TDW4 575 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ASB10Q8WXI3 467 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ST8SIA4Q92187 359 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 C1orf198Q9H425 327 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MED11Q9P086 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CA14Q9ULX7 337 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HHLA2Q9UM44 414 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PQD3 144 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HSPB2A8KAH6 182 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FAM25EA8MYX2 175 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 H3BUI4 141 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 H2BFMP0C1H6 154 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 ZNF823P16415 610 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GNB3P16520 340 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CFPP27918 469 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CD34P28906 385 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MPGP29372 298 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ACTBP60709 375 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ACTG1P63261 375 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HSD11B2P80365 405 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FOXF1Q12946 379 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 UNC119Q13432 240 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TAF13Q15543 124 aa6.49□□□□□ -1.37
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