RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OR51L1Q8NGJ5 315 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 NRBF2Q96F24 287 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 GPR160Q9UJ42 338 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa21.57■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 NGFP01138 241 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OSMP13725 252 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ZNF823P16415 610 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 FASP25445 335 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 PDLIM4P50479 330 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ZNF718Q3SXZ3 478 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SLC27A4Q6P1M0 643 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 CLEC9AQ6UXN8 241 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OR5K1Q8NHB7 308 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SLC25A40Q8TBP6 338 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SLC7A6Q92536 515 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OTULINQ96BN8 352 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 CMC2Q9NRP2 79 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa21.56■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 VPS13CQ709C8 3753 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OR6C6A6NF89 314 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 TVP23AA6NH52 213 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 GYPBP06028 91 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 NAT2P11245 290 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 GINS1Q14691 196 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 C1orf174Q8IYL3 243 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SNX33Q8WV41 574 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OR2J1Q9GZK6 312 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 HDHD2Q9H0R4 259 aa21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ICMTO60725 284 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 FCGR1AP12314 374 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 DAOP14920 347 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SPI1P17947 270 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SLC25A1P53007 311 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 HIST1H3AP68431 136 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 MOGQ16653 247 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ELFN2Q5R3F8 820 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SLC18B1Q6NT16 456 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 HIST2H3AQ71DI3 136 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 Q71RC1 249 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 C10orf105Q8TEF2 133 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ZNRF4Q8WWF5 429 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 DNAJC9Q8WXX5 260 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ATPIF1Q9UII2 106 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 KCNG2Q9UJ96 466 aa21.54■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ACANP16112 2415 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 DBHP09172 617 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 CLUP10909 449 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 SLC25A16P16260 332 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 FMO3P31513 532 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 MPV17P39210 176 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 CFAP77Q6ZQR2 320 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 OR6K6Q8NGW6 343 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 LRTOMTQ8WZ04 291 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 PITX2Q99697 317 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 COQ7Q99807 217 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 PIMREGQ9BSJ6 248 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa21.53■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 FAM183AA6NL82 134 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 G3V2T6 193 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 LY6G6DO95868 133 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 MT-ND5P03915 603 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ZNF23P17027 643 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 PAICSP22234 425 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 GGT2P36268 569 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 ACSM5Q6NUN0 579 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 LYPD4Q6UWN0 246 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 TEX12Q9BXU0 123 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 MED20Q9H944 212 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 TBCCD1Q9NVR7 557 aa21.52■■□□□ 1.04
PDF-201ENST00000288022 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 IGHV3-13P01766 116 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 HMGN1P05114 100 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 RPS27P42677 84 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 DAPP51397 102 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 FAHD1Q6P587 224 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 ZNF511Q8NB15 262 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 UBASH3BQ8TF42 649 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 PLEKHA8Q96JA3 519 aa21.51■■□□□ 1.03
PDF-201ENST00000288022 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms