RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 TMEM156Q8N614 296 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RLN3Q8WXF3 142 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RELTQ969Z4 430 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CRB3Q9BUF7 120 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ADAM19Q9H013 955 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RAB33BQ9H082 229 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CSF2RBP32927 897 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GFERP55789 205 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PPP1CAP62136 330 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MAP6Q96JE9 813 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GHRLQ9UBU3 117 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NPTNQ9Y639 398 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 BCL2L11O43521 198 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 UPK3AO75631 287 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ZNF28P17035 718 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OPN5Q6U736 354 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 TO15178 435 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CD63P08962 238 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CX3CR1P49238 355 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RNF4P78317 190 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ELP2Q6IA86 826 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MDGA2Q7Z553 956 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SVBPQ8N300 66 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 KDM8Q8N371 416 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GPR119Q8TDV5 335 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR5H14A6NHG9 310 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 HRKO00198 91 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 DVL2O14641 736 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-34P06331 123 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ACSM4P0C7M7 580 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ZNF806P0C7X5 589 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PPA1Q15181 289 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 UQCC3Q6UW78 93 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ABI3Q9P2A4 366 aa7.96□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LTBP2Q14767 1821 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 PIN1P1O15428 100 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GABRA1P14867 456 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FOSL2P15408 326 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ABCD3P28288 659 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 BTCP35070 178 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 HERV-K104P61576 105 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZP4Q12836 540 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CBLN3Q6UW01 205 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 COX15Q7KZN9 410 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SPRED2Q7Z698 418 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 RNF141Q8WVD5 230 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 MARC2Q969Z3 335 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SYT3Q9BQG1 590 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 FITM1A5D6W6 292 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 SRFP11831 508 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 GLB1P16278 677 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 ITGA3P26006 1051 aa7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
HERC3-201ENST00000264345 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms