RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	P2RY10	O00398	339 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TPPP	O94811	219 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	KMT5C	Q86Y97	462 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	EMC3	Q9P0I2	261 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HHLA2	Q9UM44	414 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GDF9	O60383	454 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	NAT2	P11245	290 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PI4KA	P42356	2102 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	BID	P55957	195 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CSRP2	Q16527	193 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GPAT4	Q86UL3	456 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		R4GMQ9	66 aa		11.71	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPC1	479 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		M0R233	179 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	EFNA2	O43921	213 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	IGHM	P01871	453 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CSF1	P09603	554 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ENPP1	P22413	925 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	EMP2	P54851	167 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQM1	296 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	OR2J2	O76002	312 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL12	P48061	93 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ST7L	Q8TDW4	575 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ST8SIA1	Q92185	356 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PNR3	127 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		M0QYG6	137 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CSN2	P05814	226 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	GNAL	P38405	381 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	MAP2K6	P52564	334 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SCAND1	P57086	179 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	STARD6	P59095	220 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	FAM166A	Q6J272	317 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	THRSP	Q92748	146 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152		A6NIZ1	184 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	SCO1	O75880	301 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CPN1	P15169	458 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RAP1B	P61224	184 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	RAP1A	P62834	184 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	CCL7	P80098	99 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BRF1-222	ENST00000635152	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.69	□□□□□ -0.54

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