RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WV62	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC01619	G3V211	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP6C	O00743	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RS1	O15537	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ENTPD5	O75356	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RHBDL1	O75783	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFB2	O95178	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	UBL4A	P11441	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB4	P48594	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	DLK1	P80370	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKL1	Q00532	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RUNX1	Q01196	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CD300C	Q08708	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CUL3	Q13618	768 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8N402	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPI3	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PANO1	I0J062	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFB3	O43676	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNK2	O95069	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMG1	O95456	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ARG1	P05089	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CD7	P09564	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF43	P17038	809 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KITLG	P21583	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CD24	P25063	80 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NOS3	P29474	1203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF11	Q15544	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		F5H5P2	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	UPK1A	O00322	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	EREG	O14944	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SCN2B	O60939	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4F21	O95013	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NKX2-2	O95096	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA4L	O95757	839 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	APOC2	P02655	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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