RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAM1Q15629 374 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPNQ5VXI9 398 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 OTPQ5XKR4 325 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2J2Q8N2K1 259 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf49Q9H741 205 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ASH2LQ9UBL3 628 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 BSNQ9UPA5 3926 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 TTLL8A6PVC2 850 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 IL2RAP01589 272 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 DCTDP32321 178 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 GCNT2Q8N0V5 402 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A24Q8N4F4 322 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SLAMF6Q96DU3 332 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP6Q96JE9 813 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 COQ7Q99807 217 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 NIPAL2Q9H841 368 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOVL3Q9HB03 270 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 STUB1Q9UNE7 303 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF878C9JN71 531 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 AIREO43918 545 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-9P01782 118 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 GALP22466 123 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 MPGP29372 298 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 PCBD1P61457 104 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H3AP68431 136 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK5R1Q15078 307 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 CTF1Q16619 201 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF544Q6NX49 715 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 FDX2Q6P4F2 183 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRN1Q6UXK5 716 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 TFAP2EQ6VUC0 442 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SEM1Q6ZVN7 128 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H3AQ71DI3 136 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS4Y2Q8TD47 263 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM19Q96E16 107 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNN2Q9H2S1 579 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 DSPP15924 2871 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 E9PI62 339 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BMQ9 156 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD9O00233 223 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC19A2O60779 497 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 GADD45AP24522 165 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 FAPQ12884 760 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 CORO6Q6QEF8 472 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 LRP12Q9Y561 859 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A1O15245 554 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 OPRL1P41146 370 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF813Q6ZN06 617 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFP41Q8N8Y5 198 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS50Q9UI38 385 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ACACBO00763 2458 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SHANK1Q9Y566 2161 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 GPRIN2O60269 458 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DPB1P04440 258 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 H2BFMP0C1H6 154 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 B4GALT1P15291 398 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SCRN3Q0VDG4 424 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP77Q6ZQR2 320 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 DOLPP1Q86YN1 238 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC18Q8N456 261 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A15Q8N5U1 240 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM64BA6NI03 449 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ARF1P84077 181 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 DPPA2Q7Z7J5 298 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPMQ9NSP4 180 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SSR3Q9UNL2 185 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa27.25■■□□□ 1.95
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CAPNS1-206ENST00000588815 PKD1L2Q7Z442 2459 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYBB2P43320 205 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR9P51686 369 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 GRB2P62993 217 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7E24Q6IFN5 339 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL9Q6T311 187 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZT83 130 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10S1Q8NGN2 331 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 HTRA1Q92743 480 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51E2Q9H255 320 aa27.24■■□□□ 1.95
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