RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	VLDLR	P98155	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	POU6F1	Q14863	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRAM2	Q15035	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TGFBI	Q15582	683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UFD1	Q92890	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UCK2	Q9BZX2	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDC7	O00311	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR10H3	O60404	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF253	O75346	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM107A	O95990	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPN2	P04844	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FOLR2	P14207	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GSTM3	P21266	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CXCR2	P25025	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT1A3	P35503	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT1A5	P35504	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAP3K8	P41279	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERF	P50548	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCR8	P51685	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAP1B	P61224	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERVK-25	P63136	954 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB40B	Q12829	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNF212	Q495C1	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIGC	Q92535	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RBBP8	Q99708	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NPAS2	Q99743	824 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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