RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF426Q9BUY5 554 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 GCM1Q9NP62 436 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 IL19Q9UHD0 177 aa14.64□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PPL8 197 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MELTFP08582 738 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FUT1P19526 365 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 GPR157Q5UAW9 335 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FAM27BQ5VT28 67 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 OR5AS1Q8N127 324 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CMBLQ96DG6 245 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SPDL1Q96EA4 605 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MPP4Q96JB8 637 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 EVPLLA8MZ36 301 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 M0QX08 132 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SURF4O15260 269 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 OR7A10O76100 309 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CST2P09228 141 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 GPX2P18283 190 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CD247P20963 164 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PDCD1Q15116 288 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FAM201AQ5SY85 155 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ARL9Q6T311 187 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PTOV1Q86YD1 416 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 OR8B2Q96RD0 313 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM165Q9HC07 324 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NOX4Q9NPH5 578 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MIOXQ9UGB7 285 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MT-ND1P03886 318 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 KITLGP21583 273 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 HTR5AP47898 357 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PITPNBP48739 271 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PCBD1P61457 104 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CYP51A1Q16850 503 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FBLN7Q53RD9 439 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TTMPQ5BVD1 217 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 FITM2Q8N6M3 262 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 LINC01006Q8NI28 216 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SGTBQ96EQ0 304 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 GMNCA6NCL1 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 DOK2O60496 412 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ERLIN1O75477 346 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SFTPBP07988 381 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NR2C1P13056 603 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 LAPTM4AQ15012 233 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM86BQ8N661 226 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 CLN8Q9UBY8 286 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 STARD10Q9Y365 291 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 GMEB1Q9Y692 573 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM120BA0PK00 339 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 GPR137BO60478 399 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 SCG5P05408 212 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 MSR1P21757 451 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 PROK1P58294 105 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF404Q494X3 552 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms