RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PAK5	Q9P286	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C3orf18	Q9UK00	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SEC16A	O15027	2179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OPN1MW	P04001	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MELTF	P08582	738 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ANXA5	P08758	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NT5E	P21589	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC26A3	P40879	764 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR1D4	P47884	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	EMP2	P54851	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ARG2	P78540	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CDK16	Q00536	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM53B	Q14153	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	FCN2	Q15485	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MICA	Q29983	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	COX15	Q7KZN9	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A1W2PNV4	684 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A1W2PPR1	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A1W2PPV9	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IDS	B3KWA1	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725		H0YGG7	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RIPK2	O43353	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	REN	P00797	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ERG	P11308	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CPN1	P15169	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	GRIA1	P42261	906 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PDK3	Q15120	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PSMF1	Q92530	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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