RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF681	Q96N22	645 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PANX1	Q96RD7	426 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GAL3ST1	Q99999	423 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CA10	Q9NS85	328 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ACER3	Q9NUN7	267 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NTM	Q9P121	344 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984		Q9UFV3	132 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1W2PNR3	127 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SERTM1	A2A2V5	107 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	DISC1	C4P0D8	188 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MANBA	O00462	879 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FZD7	O75084	574 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ULK1	O75385	1050 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RAB36	O95755	333 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	HPN	P05981	417 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CBR1	P16152	277 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NT5E	P21589	574 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RFX3	P48380	749 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PITPNB	P48739	271 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	VEGFC	P49767	419 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NRG3	P56975	720 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TESK1	Q15569	626 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM64	Q6YI46	380 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	OAF	Q86UD1	273 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MMP21	Q8N119	569 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PXT1	Q8NFP0	134 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	DIO2	Q92813	273 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ARL6	Q9H0F7	186 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FN3K	Q9H479	309 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GHRL	Q9UBU3	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	DOCK7	Q96N67	2140 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ARPC5	O15511	151 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	AKR7A3	O95154	331 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SOX14	O95416	240 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	IGF2	P01344	180 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CD3G	P09693	182 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ABCD3	P28288	659 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PTGDS	P41222	190 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	LGALS3BP	Q08380	585 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ECH1	Q13011	328 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	GUCA2B	Q16661	112 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	HACD4	Q5VWC8	232 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM17	Q86X19	198 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CMIP	Q8IY22	773 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	UCN2	Q96RP3	112 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	ACPT	Q9BZG2	426 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FGD4-215	ENST00000551984	EXO5	Q9H790	373 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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