RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 RAB31Q13636 194 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SERTAD2Q14140 314 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PYCR3Q53H96 274 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 STRADAQ7RTN6 431 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PXT1Q8NFP0 134 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CT55Q8WUE5 264 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FKBP10Q96AY3 582 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DGAT2Q96PD7 388 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR6C1Q96RD1 312 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ASCL2Q99929 193 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SIX2Q9NPC8 291 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 LHX9Q9NQ69 397 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GHRLQ9UBU3 117 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DUX4Q9UBX2 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ZNF639Q9UID6 485 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 HSF4Q9ULV5 492 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RASD1Q9Y272 281 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ARL5AQ9Y689 179 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SEC16AO15027 2179 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 LIPT2A6NK58 231 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 H3BMQ9 156 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 M0R036 132 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CLIC1O00299 241 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 KLK8O60259 260 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 KIAA0513O60268 411 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TPST1O60507 370 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CEACAM4O75871 244 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GADD45GO95257 159 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 IFNA5P01569 189 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GYPCP04921 128 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 KITP10721 976 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RAB3BP20337 219 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 LHCGRP22888 699 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 BSGP35613 385 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CEACAM3P40198 252 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GFERP55789 205 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SLC37A1P57057 533 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ZP1P60852 638 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 BCL2L1Q07817 233 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 KRT33BQ14525 404 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 IL11RAQ14626 422 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 S100A7AQ86SG5 101 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TERB2Q8NHR7 220 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CD200R1Q8TD46 325 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TMEM234Q8WY98 164 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FUZQ9BT04 418 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FICDQ9BVA6 458 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 P2RY12Q9H244 342 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ARV1Q9H2C2 271 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 WDR54Q9H977 334 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CUTCQ9NTM9 273 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PADI1Q9ULC6 663 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 LILRA5A6NI73 299 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 H3BN98 237 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 F2RL2O00254 374 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD28O15084 1053 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 EMC8O43402 210 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 HTR1AP08908 422 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 FGF5P12034 268 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 GABRA1P14867 456 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 C4BPBP20851 252 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms