RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 CD27P26842 260 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 NHLRC1Q6VVB1 395 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 FJX1Q86VR8 437 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 STX12Q86Y82 276 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 MFSD8Q8NHS3 518 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SPTSSAQ969W0 71 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 OR8B4Q96RC9 309 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CFHR5Q9BXR6 569 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SCRG1O75711 98 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 RECKO95980 971 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 AKR1C2P52895 323 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A1P53007 311 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 HSF1Q00613 529 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 AKR1C1Q04828 323 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF141Q15928 474 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CHRDL2Q6WN34 429 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SULF2Q8IWU5 870 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 FAM71CQ8NEG0 241 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 OR52N5Q8NH56 324 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SCMH1Q96GD3 660 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CMTM3Q96MX0 182 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 KCNJ15Q99712 375 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SCPEP1Q9HB40 452 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 HSPA12AO43301 675 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 M6PRP20645 277 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CLDN17P56750 224 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SLC26A5P58743 744 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 FAM74A1Q5RGS3 127 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 C17orf107Q6ZR85 190 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 OR56B1Q8NGI3 324 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 BORCS8Q96FH0 119 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 C4orf45Q96LM5 186 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 VSTM2LQ96N03 204 aa12□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ST8SIA4Q92187 359 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 NUDT9Q9BW91 350 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 S1PR5Q9H228 398 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 PTPRDP23468 1912 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 G3V3Y1 287 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 TSPAN15O95858 294 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 PRKACAP17612 351 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CAMLGP49069 296 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 GABREP78334 506 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CD226Q15762 336 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 OR6C1Q96RD1 312 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 DTX4Q9Y2E6 619 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 PTP4A3O75365 173 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF117Q03924 483 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 IMPA2O14732 288 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 IL5P05113 134 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CCR5P51681 352 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 GABRG3Q99928 467 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 CHRDQ9H2X0 955 aa11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 FRG2CA6NGY1 282 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 FCGR2AP12318 317 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 TFF2Q03403 129 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 KCNK15Q9H427 330 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 KCNE5Q9UJ90 142 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 TNFSF14O43557 240 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ACSM4P0C7M7 580 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 HYAL1Q12794 435 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 FZD2Q14332 565 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ABI3Q9P2A4 366 aa11.98□□□□□ -0.49
SPCS3-201ENST00000503362 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms