RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 RPL4P36578 427 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MTNR1AP48039 350 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 HSPA13P48723 471 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TDGF1P3P51864 188 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MLLT10P55197 1068 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CASP6P55212 293 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CARD18P57730 90 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PRPS1P60891 318 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ERVK-25P63136 954 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 H3F3AP84243 136 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CDK5Q00535 292 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PUDPQ08623 228 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 KEAP1Q14145 624 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PON3Q15166 354 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PGGHGQ32M88 737 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 AWAT1Q58HT5 328 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 WLSQ5T9L3 541 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF691Q5VV52 312 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 C12orf73Q69YU5 71 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 FCRLAQ7L513 359 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GPAT4Q86UL3 456 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GHDCQ8N2G8 530 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SCAIQ8N9R8 606 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR2T33Q8NG76 320 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OSTF1Q92882 214 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MUS81Q96NY9 551 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TSPAN32Q96QS1 320 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 KATNB1Q9BVA0 655 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 IFT27Q9BW83 186 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 FANCFQ9NPI8 374 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 INIPQ9NRY2 104 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 AASSQ9UDR5 926 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 RAB26Q9ULW5 256 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CACNA1GO43497 2377 aa4.85□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 BSNQ9UPA5 3926 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF716A6NP11 495 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 IMPA2O14732 288 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SURF4O15260 269 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PRKYO43930 277 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CYTIPO60759 359 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 AQP8O94778 261 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 OR6A2O95222 327 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TGM6O95932 706 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 IGHMP01871 453 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CD14P08571 375 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MYF6P23409 242 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 SMSP52788 366 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 PROK1P58294 105 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 CDC42P60953 191 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ISL1P61371 349 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MYBPC1Q00872 1141 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 ZP4Q12836 540 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 IL18R1Q13478 541 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 MELKQ14680 651 aa4.84□□□□□ -1.63
GAPVD1-218ENST00000495588 TAF11Q15544 211 aa4.84□□□□□ -1.63
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