RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491387.1

APOBEC3F-204, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3F, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-204ENST00000491387 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 LRRC18Q8N456 261 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 RNF148Q8N7C7 305 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 OR2T12Q8NG77 320 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 ST7LQ8TDW4 575 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 TMEM239Q8WW34 195 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 WACQ9BTA9 647 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 NPTNQ9Y639 398 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.13□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 C5orf49A4QMS7 147 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 CDC42EP2O14613 210 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SPRY3O43610 288 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 OR5F1O95221 314 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 CST2P09228 141 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 COX5BP10606 129 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 IFI30P13284 250 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 GSK3BP49841 420 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 PAX8Q06710 450 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SPRNQ5BIV9 151 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SGTBQ96EQ0 304 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 ALG12Q9BV10 488 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 POFUT1Q9H488 388 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.12□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 ZNF69Q9UC07 566 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 AUP1Q9Y679 476 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 V9GYQ6 96 aa7.12□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 MCIDASD6RGH6 385 aa7.11□□□□□ -1.27
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APOBEC3F-204ENST00000491387 ZNF682O95780 498 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 GPANK1O95872 356 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SERPINA1P01009 418 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 NGFP01138 241 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 THRBP10828 461 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 KITLGP21583 273 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 NUDT2P50583 147 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 PCBD1P61457 104 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 PPP1CBP62140 327 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 ERVK-25P63136 954 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 SELENOWP63302 87 aa7.11□□□□□ -1.27
APOBEC3F-204ENST00000491387 PAX2Q02962 417 aa7.11□□□□□ -1.27
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