RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	FAS	P25445	335 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	FHL1	Q13642	323 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	DOK3	Q7L591	496 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PRG6	482 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ENTPD5	O75356	428 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SEC14L2	O76054	403 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF432	O94892	652 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV2-5	P01817	119 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	FPR3	P25089	353 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	MAGEB1	P43366	347 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GSS	P48637	474 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CTXN1	P60606	82 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	BAMBI	Q13145	260 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TAF11	Q15544	211 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OCLN	Q16625	522 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RCE1	Q9Y256	329 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PPW3	197 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SLC43A1	O75387	559 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFB2	O95178	105 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	PRKACG	P22612	351 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GCH1	P30793	250 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GLRX	P35754	106 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	BID	P55957	195 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	LEG1	Q6P5S2	330 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	FEV	Q99581	238 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GPR35	Q9HC97	309 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	DUSP13	Q9UII6	198 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344		H3BNX3	289 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ALX3	O95076	343 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	HLA-H	P01893	362 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CD79A	P11912	226 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GSTM3	P21266	225 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GATA3	P23771	443 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	LCN2	P80188	198 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	MELK	Q14680	651 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	RFX4	Q33E94	735 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM123	Q8N131	208 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	LRR1	Q96L50	414 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM3-208	ENST00000489344		G3V2T6	193 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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