RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 AQP6Q13520 282 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF786Q8N393 782 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 YAE1D1Q9NRH1 226 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 VNN3Q9NY84 501 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 U3KQV3 271 aa20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 DCTN6O00399 190 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 COX5BP10606 129 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 HTR5AP47898 357 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF718Q3SXZ3 478 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA46Q5T0L3 261 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ARL9Q6T311 187 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD4Q8TB40 342 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SNX33Q8WV41 574 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SNX18Q96RF0 628 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 BPESC1Q9GZL8 116 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 B9D1Q9UPM9 204 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 JMJD1CQ15652 2540 aa20.53■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 LYNX1G3V0Z9 82 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 GPANK1O95872 356 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 LYNX1P0DP58 116 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 GCH1P30793 250 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 KCNMB1Q16558 191 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 MOGQ16653 247 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 MICAQ29983 383 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf174Q8IYL3 243 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRG5Q8IZF4 528 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 OR6V1Q8N148 313 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 SLC25A40Q8TBP6 338 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 C4orf45Q96LM5 186 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 CHID1Q9BWS9 393 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 ELOVL3Q9HB03 270 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 PLEK2Q9NYT0 353 aa20.52■□□□□ 0.88
SMKR1-201ENST00000462322 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 AQP12BA6NM10 295 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 NGFP01138 241 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 HPXP02790 462 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 GIFP27352 417 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGDIAP52565 204 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1CBP62140 327 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 GLO1Q04760 184 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 DHRS12A0PJE2 317 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 OR6C68A6NDL8 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 C17orf100A8MU93 164 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 ICMTO60725 284 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD16AO95870 558 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 IGHV3-13P01766 116 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 MT-ND5P03915 603 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 GAAP10253 952 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 MEP1BQ16820 701 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 OR2J1Q9GZK6 312 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 FN3KQ9H479 309 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 IL20Q9NYY1 176 aa20.5■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 CST1P01037 141 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 MPV17P39210 176 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 FLOT2Q14254 428 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 ELFN2Q5R3F8 820 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 CYB5R2Q6BCY4 276 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA24Q86W54 205 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 OR1F12Q8NHA8 337 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 RDH5Q92781 318 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.49■□□□□ 0.87
SMKR1-201ENST00000462322 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms