RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 FAM183AA6NL82 134 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 H3BMH7 237 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 M0R233 179 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 GNAO1P09471 354 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SELEP16581 610 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 POU3F4P49335 361 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 RGS6P49758 472 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ALDH3A2P51648 485 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 VWA1Q6PCB0 445 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PLXNA2O75051 1894 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PSMD9O00233 223 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 APOL3O95236 402 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PLATP00750 562 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MYL9P24844 172 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SELENOPP49908 381 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CSNK2BP67870 215 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF846Q147U1 533 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 EMC4Q5J8M3 183 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SHISA5Q8N114 240 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 OR4F15Q8NGB8 312 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PIGTQ969N2 578 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MARVELD3Q96A59 401 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MOKQ9UQ07 419 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TGM6O95932 706 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 IL18BPO95998 194 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF1AP19438 455 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 OR3A3P47888 321 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CRMP1Q14194 572 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PIGCQ92535 297 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 NIPAL2Q9H841 368 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.23□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.092e-8■■■■■ 31.7
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS37A4D1T9 235 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 IGHG3P01860 377 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SERPINA5P05154 406 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 THBS2P35442 1172 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MADCAM1Q13477 382 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SHEQ5VZ18 495 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 FAM57BQ71RH2 274 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CMTM3Q96MX0 182 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 RDH12Q96NR8 316 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 NUAK2Q9H093 628 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 UBQLN3Q9H347 655 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF724A8MTY0 619 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CCNKO75909 580 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SCN1BQ07699 218 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 OR5AS1Q8N127 324 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 OR6X1Q8NH79 312 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CCL19Q99731 98 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 VCANP13611 3396 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0X1KG70 313 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 C17orf51A8MQB3 221 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PLPP3O14495 311 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SLC22A1O15245 554 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 SYT7O43581 403 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 KDM4BO94953 1096 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 HMG20AQ9NP66 347 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.22□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms