RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 HRASLS5Q96KN8 279 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa26.06■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 E7EQL1 145 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 DLGAP1O14490 977 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 RER1O15258 196 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 PTHP01270 115 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SLC2A5P22732 501 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 HGFACQ04756 655 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM163Q8TC26 289 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 NRG4Q8WWG1 115 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 IL4I1Q96RQ9 567 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 C1orf198Q9H425 327 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ATP23Q9Y6H3 246 aa26.05■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 PRODHO43272 600 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 PSKH1P11801 424 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF823P16415 610 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 STOMP27105 288 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 RPS27P42677 84 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 BLVRAP53004 296 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 HIST1H3AP68431 136 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ADAM8P78325 824 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 KLHL12Q53G59 568 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SLC18B1Q6NT16 456 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 HIST2H3AQ71DI3 136 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 LINC00346Q8IVM7 164 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 FBXW5Q969U6 566 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CDADC1Q9BWV3 514 aa26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 LOC100509620A0A075B734 347 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SGCEO43556 437 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF611Q8N823 705 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 POM121L2Q96KW2 1035 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 PLEK2Q9NYT0 353 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 KCNG2Q9UJ96 466 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 DSCAMO60469 2012 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 APLNRP35414 380 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 GJC3Q8NFK1 279 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 MARCH7Q9H992 704 aa26.03■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 DOK2O60496 412 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 APOFQ13790 326 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 PCK2Q16822 640 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D28Q2M2D7 210 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SLC35D3Q5M8T2 416 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 AADACL4Q5VUY2 407 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 PACRGLQ8N7B6 248 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 OR4F15Q8NGB8 312 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf4Q9NR00 106 aa26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 SYNGR3O43761 229 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 GSTT1P30711 240 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 ENTPD1P49961 510 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 CDC42P60953 191 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 TEX30Q5JUR7 227 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 PAMR1Q6UXH9 720 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 CFAP77Q6ZQR2 320 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 NUP37Q8NFH4 326 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 OR1J2Q8NGS2 313 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 FAM81AQ8TBF8 368 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2FQ969M7 185 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 TEAD3Q99594 435 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 CDH20Q9HBT6 801 aa26.01■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 C5orf49A4QMS7 147 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 COX5BP10606 129 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 NR4A1P22736 598 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 RPS7P62081 194 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 NXNL2Q5VZ03 156 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 KRT80Q6KB66 452 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 TIGD4Q8IY51 512 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 OR8J1Q8NGP2 316 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 MAP6Q96JE9 813 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 RDH12Q96NR8 316 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 PITX2Q99697 317 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 CA10Q9NS85 328 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 FAM118AQ9NWS6 357 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa26■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC182A6NF36 153 aa25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 OR6C6A6NF89 314 aa25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 CCNOP22674 350 aa25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 GDI2P50395 445 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 RAB35Q15286 201 aa25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 C20orf204Q6ZNR8 217 aa25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 INTS14Q96SY0 518 aa25.99■■□□□ 1.75
PKDCC-202ENST00000401498 DHRS9Q9BPW9 319 aa25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms