RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 DCST2Q5T1A1 773 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C18orf63Q68DL7 685 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ULK3Q6PHR2 472 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT16Q8N428 558 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 COX18Q8N8Q8 333 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PFN4Q8NHR9 129 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HMGB4Q8WW32 186 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZG16BQ96DA0 208 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PEX11GQ96HA9 241 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CKLFQ9UBR5 152 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPV9 198 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TVP23AA6NH52 213 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 F8VVB4 439 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 F8VWA3 439 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CTAG2O75638 210 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZFPL1O95159 310 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LYPD3O95274 346 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA4FO95754 770 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PET100P0DJ07 73 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PTAFRP25105 342 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TACR3P29371 465 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 BDKRB2P30411 391 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 AKT2P31751 481 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CASRP41180 1078 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CX3CR1P49238 355 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 YPEL5P62699 121 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RPE65Q16518 533 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 FAM209BQ5JX69 171 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MANEAQ5SRI9 462 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SSX6Q7RTT6 188 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF561Q8N587 486 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR51A7Q8NH64 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GPX8Q8TED1 209 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PTX4Q96A99 478 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 OR51M1Q9H341 326 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS50Q9UI38 385 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GLOD5A6NK44 160 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 K7ESM1 405 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 GPR31O00270 319 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 SLC17A2O00624 439 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2CO00762 179 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 TAAR5O14804 337 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 LATO43561 262 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 APBB3O95704 486 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 WNT11O96014 354 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 CD79AP11912 226 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 MAOAP21397 527 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 ACHEP22303 614 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-201ENST00000372616 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms