RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPIN2AQ99865 258 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 C20orf24Q9BUV8 137 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPNS1Q9H2V7 528 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRA2Q9H9E1 313 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF160Q9HCG1 818 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGALS13Q9UHV8 139 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLIT3O75094 1523 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 C7orf66A4D0T2 115 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM64CA6NLI5 447 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFAB1O14561 156 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST1O43916 411 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 RDH16O75452 317 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXH1O75593 365 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 H6PDO95479 791 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGTP01019 485 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR56A5P0C7T3 313 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGT1P19440 569 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSTR5P35346 364 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 PMELP40967 661 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CX3CR1P49238 355 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 RND2P52198 227 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SP4Q02446 784 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELENBP1Q13228 472 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOBPQ13875 183 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 IDI1Q13907 227 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 RCN1Q15293 331 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ORMDL2Q53FV1 153 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMUG1Q53HV7 270 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE2UQ5VVX9 321 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRMT9Q6P2P2 845 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXW12Q6X9E4 464 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR86Q86TI4 376 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBALD2Q8IYN6 164 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMTM1Q8IZ96 169 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGI3Q8N145 548 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL13Q8N6R0 699 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFP41Q8N8Y5 198 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4C5Q8NGB2 326 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF461Q8TAF7 563 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 C15orf40Q8WUR7 153 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC29Q8WV35 223 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM230Q96A57 120 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCUR1Q96AQ8 359 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ECHDC3Q96DC8 303 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00477Q96M19 166 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTN4Q9HB63 628 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEK6Q9HC98 313 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF835Q9Y2P0 537 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 NINLQ9Y2I6 1382 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOTCH2Q04721 2471 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A075B6Q4 140 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1B0GW55 424 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR6C74A6NCV1 312 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 L7N2F9 121 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGK1O00141 431 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD51CO43502 376 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARG1P05089 322 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERPINE2P07093 398 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD3GP09693 182 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF286BP0CG31 522 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUX4L2P0CJ85 424 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUX4L3P0CJ86 424 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUX4L5P0CJ88 424 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUX4L6P0CJ89 424 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUX4L7P0CJ90 424 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT45A6P0DMU7 189 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT45A5P0DMU8 189 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CT45A7P0DMV0 189 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERGP11308 486 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCAR3P49019 387 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRISP1P54107 249 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1CBP62140 327 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS15P62841 145 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 BEX3Q00994 111 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CUL2Q13617 745 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHHQ15465 462 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNA6Q15825 494 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMD5Q16401 504 aa1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms