RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PRG6 482 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 LRRN3E7EW58 273 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 CHP2O43745 196 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 XPNPEP2O43895 674 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 FSTL3O95633 263 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ABHD16AO95870 558 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 HIST1H2ABP04908 130 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF32P17041 273 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 FUT4P22083 530 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 EPHA3P29320 983 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 PCBD1P61457 104 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 UFM1P61960 85 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 HIST3H3Q16695 136 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF404Q494X3 552 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SPRNQ5BIV9 151 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 C10orf128Q5T292 105 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 MCHR2Q969V1 340 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ITCHQ96J02 903 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 TEX37Q96LM6 180 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 COG8Q96MW5 612 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 C16orf95Q9H693 158 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 GCM1Q9NP62 436 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.2□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 H0YL77 283 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 TOX4O94842 621 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV4-59P01825 116 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SERPINE1P05121 402 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 LIPFP07098 398 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 BPGMP07738 259 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 FAM153BP0C7A2 387 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 UMPSP11172 480 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 BMP2P12643 396 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 IRF2P14316 349 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 KITLGP21583 273 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 CFHR2P36980 270 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 NPY4RP50391 375 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 CDH12P55289 794 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 GUCY1A3Q02108 690 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 EGR3Q06889 387 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 PSG7Q13046 419 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 HERPUD1Q15011 391 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 OR1Q1Q15612 314 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF74Q16587 644 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 CD276Q5ZPR3 534 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF613Q6PF04 617 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 C11orf88Q6PI97 169 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 Q6ZSV7 163 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SGCDQ92629 289 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF347Q96SE7 839 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF607Q96SK3 696 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SEPHS2Q99611 448 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF879B4DU55 563 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 FMO6PO60774 539 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SPAG7O75391 227 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV1-69P01742 117 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SFTPBP07988 381 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 THRBP10828 461 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 IDO1P14902 403 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ACADSP16219 412 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 IER3P46695 156 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 ERVK-25P63136 954 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 CD47Q08722 323 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 RGNQ15493 299 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 KCNJ8Q15842 424 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 HHATQ5VTY9 493 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 REEP3Q6NUK4 255 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 SPERTQ8NA61 448 aa7.18□□□□□ -1.26
HLA-B-257ENST00000640094 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.18□□□□□ -1.26
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