RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 WDR76Q9H967 626 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FKBP14Q9NWM8 211 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF224Q9NZL3 707 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 LRCH1Q9Y2L9 728 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 A0A096LPE4 126 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PPZ6 126 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 NKX2-6A6NCS4 301 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC1A7O00341 560 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SELENOFO60613 162 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SEC14L2O76054 403 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 AGFG2O95081 481 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 UBL3O95164 117 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CCKARP32238 428 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PCBD1P61457 104 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ADAM8P78325 824 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 AQP6Q13520 282 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 MEP1BQ16820 701 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC36A2Q495M3 483 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 RHOUQ7L0Q8 258 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CDC20BQ86Y33 519 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 LRRC18Q8N456 261 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 WDR31Q8NA23 367 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OTOSQ8NHW6 89 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 HSD17B8Q92506 261 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 GGHQ92820 318 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 LGALS12Q96DT0 336 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FBXO17Q96EF6 278 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SH3GL3Q99963 347 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 JAM3Q9BX67 310 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ACTR6Q9GZN1 396 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 KCNN2Q9H2S1 579 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 AMBNQ9NP70 447 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 EMC7Q9NPA0 242 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa10.06□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 XPNPEP2O43895 674 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 IGHA1P01876 353 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OR2T7P0C7T2 308 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PSKH1P11801 424 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ALOX5APP20292 161 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CRHBPP24387 322 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ARR3P36575 388 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PEX19P40855 299 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ACTC1P68032 377 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ACTA1P68133 377 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC35A2P78381 396 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TSC22D1Q15714 1073 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC18B1Q6NT16 456 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 DPY19L4Q7Z388 723 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 EGFL6Q8IUX8 553 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 GJC3Q8NFK1 279 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OR6N2Q8NGY6 317 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OR2T27Q8NH04 317 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FGFBP3Q8TAT2 258 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 HTRA1Q92743 480 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 S100PBPQ96BU1 408 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF75AQ96N20 296 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 DUSP21Q9H596 190 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SCN3BQ9NY72 215 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TPRKBQ9Y3C4 175 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.05□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TRIM64A6NGJ6 449 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PHYHO14832 338 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FAM20BO75063 409 aa10.04□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 WNT11O96014 354 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms