RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 DGKAP23743 735 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CERS1P27544 350 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 S100A3P33764 101 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 BLKP51451 505 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CRYBA2P53672 197 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 DLX5P56178 289 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SELENOVP59797 346 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SEMG2Q02383 582 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 VITQ6UXI7 678 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CHST5Q9GZS9 411 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 A1L4Q6 167 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 A6NIN4 97 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 DRGXA6NNA5 263 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 GABRPO00591 440 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 RGS14O43566 566 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2T1O43869 369 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 OR6A2O95222 327 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CRHP06850 196 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 GPX2P18283 190 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 LMO2P25791 158 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 S100A2P29034 98 aa6.05□□□□□ -1.44
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TSPAN3-209ENST00000560715 MEOX1P50221 254 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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TSPAN3-209ENST00000560715 DGCR2P98153 550 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 PITPNAQ00169 270 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 AMZ1Q400G9 498 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 GINS4Q9BRT9 223 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 WWOXQ9NZC7 414 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM72CH0Y354 149 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CLIC1O00299 241 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 RFXANKO14593 260 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 PTGESO14684 152 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 UBL3O95164 117 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ACTL6AO96019 429 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 IL5P05113 134 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 HOXB5P09067 269 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 IRF1P10914 325 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CYBAP13498 195 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 HOXA5P20719 270 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ADORA2BP29275 332 aa6.04□□□□□ -1.44
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TSPAN3-209ENST00000560715 LIMS1P48059 325 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 DAOAP59103 153 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CLINT1Q14677 625 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 TRAM1Q15629 374 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 C12orf73Q69YU5 71 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM72BQ86X60 149 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 TDHQ8IZJ6 230 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 LOXL4Q96JB6 756 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CASD1Q96PB1 797 aa6.04□□□□□ -1.44
TSPAN3-209ENST00000560715 CLCC1Q96S66 551 aa6.04□□□□□ -1.44
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