RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511075.5

RPL9-209, Transcript of ribosomal protein L9, human

TSL 2

Gene RPL9, Length 1,028 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL9-209	ENST00000511075	LIM2	P55344	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	RAB38	P57729	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	GPX6	P59796	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SGCA	Q16586	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	UCN3	Q969E3	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075		U3KQV3	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075		A0A0U1RQV5	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075		A0A1W2PP11	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075		A0A1W2PPI3	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CTNS	O60931	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CLPX	O76031	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	PDE5A	O76074	875 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SEMA3D	O95025	777 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ACSL3	O95573	720 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	UROS	P10746	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	MLN	P12872	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	EPOR	P19235	508 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	AP1S2	P56377	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	IL18	Q14116	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	RASD2	Q96D21	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	DDO	Q99489	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SSX3	Q99909	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	VCX2	Q9H322	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9-209	ENST00000511075	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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