RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478216.1

RC3H2-208, Transcript of ring finger and CCCH-type domains 2, human

TSL 3

Gene RC3H2, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RC3H2-208	ENST00000478216	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	CITED1	Q99966	193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	THAP1	Q9NVV9	213 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216		A0A1W2PPL8	197 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	EVPLL	A8MZ36	301 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	ZNF205	O95201	554 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	FMOD	Q06828	376 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	HIST3H3	Q16695	136 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	C10orf128	Q5T292	105 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	OR2V2	Q96R30	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	CHIA	Q9BZP6	476 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	CD247	P20963	164 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	LAP3	P28838	519 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MMP16	P51512	607 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	PCBD1	P61457	104 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	VSNL1	P62760	191 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	PSG7	Q13046	419 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TAF9	Q16594	264 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	VWF	P04275	2813 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	ERLIN1	O75477	346 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NDUFA7	O95182	113 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	WNT2	P09544	360 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	AQP2	P41181	271 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	UGT2B15	P54855	530 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MPP2	Q14168	576 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NPTX1	Q15818	432 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NOX4	Q9NPH5	578 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	IL19	Q9UHD0	177 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RC3H2-208	ENST00000478216	LRRC30	A6NM36	301 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RC3H2-208	ENST00000478216	IFNL4	K9M1U5	179 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RC3H2-208	ENST00000478216	TSPAN15	O95858	294 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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