RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	MSMP	Q1L6U9	139 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LCN8	Q6JVE9	175 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF774	Q6NX45	483 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FAM122B	Q7Z309	247 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ADCK1	Q86TW2	530 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SNX33	Q8WV41	574 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	REEP1	Q9H902	201 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	POLE4	Q9NR33	117 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	HIVEP2	P31629	2446 aa		12.74	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GNGT2	O14610	69 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DOK2	O60496	412 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CLPTM1	O96005	669 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NAT2	P11245	290 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FPR3	P25089	353 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GCH1	P30793	250 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	HTR5A	P47898	357 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	UCP2	P55851	309 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FXYD6P3	P58550	94 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	RFX4	Q33E94	735 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	OR4K13	Q8NH42	304 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD4	Q8TB40	342 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ASB9	Q96DX5	294 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TSSK2	Q96PF2	358 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NUAK2	Q9H093	628 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GPR160	Q9UJ42	338 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		12.73	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	AHCYL1	O43865	530 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MPZL1	O95297	269 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SNAP29	O95721	258 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GPANK1	O95872	356 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DQA2	P01906	255 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SCG5	P05408	212 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LYNX1	P0DP58	116 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ERF	P50548	548 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN31	Q12999	210 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA24	Q86W54	205 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	NMNAT3	Q96T66	252 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	FN3K	Q9H479	309 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	SGCE	O43556	437 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD16A	O95870	558 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ND5	P03915	603 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	CRABP1	P29762	137 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	GSS	P48637	474 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	EVX1	P49640	407 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGDIA	P52565	204 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SSR4-208	ENST00000471880	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms