RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455020.2

SPDYE2B-202, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-202ENST00000455020 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NANSQ9NR45 359 aa16.5■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.5■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 IDO1P14902 403 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ERFP50548 548 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 CDK6Q00534 326 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 HHATQ5VTY9 493 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 REEP3Q6NUK4 255 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 KRT73Q86Y46 540 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 FITM2Q8N6M3 262 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 OR2V2Q96R30 315 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 CDADC1Q9BWV3 514 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.49■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 GPR137BO60478 399 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ERLIN1O75477 346 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 F13BP05160 661 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 TNFSF4P23510 183 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 BST1Q10588 318 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 GPR157Q5UAW9 335 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF613Q6PF04 617 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 C4orf45Q96LM5 186 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF607Q96SK3 696 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 MCHR1Q99705 422 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 TMEM165Q9HC07 324 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 GCM1Q9NP62 436 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 POMT1Q9Y6A1 747 aa16.48■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 C22orf46C9J442 243 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 MCIDASD6RGH6 385 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SFTPBP07988 381 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ACADSP16219 412 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 UGT2B15P54855 530 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 RPL15P61313 204 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SGCAQ16586 387 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 C1orf174Q8IYL3 243 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SSMEM1Q8WWF3 244 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 DYRK2Q92630 601 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NSMAFQ92636 917 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 IL19Q9UHD0 177 aa16.47■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 IGHV4-59P01825 116 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 UMPSP11172 480 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 KITLGP21583 273 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 STX3Q13277 289 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM201AQ5SY85 155 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SAMD5Q5TGI4 173 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NXNQ6DKJ4 435 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC27A4Q6P1M0 643 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SMYD1Q8NB12 490 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 OR6T1Q8NGN1 323 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 C10orf82Q8WW14 230 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 IKZF5Q9H5V7 419 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.46■□□□□ 0.23
SPDYE2B-202ENST00000455020 COL7A1Q02388 2944 aa16.46■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 CENPBD1B2RD01 187 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 HDAC3O15379 428 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 FMO6PO60774 539 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 LAP3P28838 519 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 PITPNBP48739 271 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARHGDIAP52565 204 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 SCARB2Q14108 478 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 MPP2Q14168 576 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARMC4Q5T2S8 1044 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.45■□□□□ 0.22
SPDYE2B-202ENST00000455020 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms