RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 KCNJ10P78508 379 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NPRL3Q12980 569 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PON3Q15166 354 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NPTX1Q15818 432 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 STK11Q15831 433 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FGD3Q5JSP0 725 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF544Q6NX49 715 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 LCTLQ6UWM7 567 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SSX8Q7RTT4 187 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR4C15Q8NGM1 316 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO30Q8TB52 745 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NT5CQ8TCD5 201 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF721Q8TF20 911 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MYDGFQ969H8 173 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CSF3RQ99062 836 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 INPP5KQ9BT40 448 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FUNDC2Q9BWH2 189 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FOLH1BQ9HBA9 442 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ESM1Q9NQ30 184 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 DKKL1Q9UK85 242 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MKLN1Q9UL63 735 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 POFUT2Q9Y2G5 429 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF175Q9Y473 711 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 FREM3P0C091 2139 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MED12LQ86YW9 2145 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 NINQ8N4C6 2090 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 E7EQL1 145 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SEC14L5O43304 696 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 INMTO95050 263 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ETHE1O95571 254 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CLIC3O95833 236 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 LAMP1P11279 417 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PCNAP12004 261 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GABRB1P18505 474 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 RHCEP18577 417 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CD22P20273 847 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 UQCRC2P22695 453 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IMPA1P29218 277 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IL2RGP31785 369 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 GGT2P36268 569 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ETV6P41212 452 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 CDKN2CP42773 168 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 STT3AP46977 705 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC37A1P57057 533 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM11AP58511 58 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 COPZ1P61923 177 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 COX10Q12887 443 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IRF3Q14653 427 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OXA1LQ15070 435 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 PPA1Q15181 289 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TSC22D1Q15714 1073 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 MICAQ29983 383 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 RGS21Q2M5E4 152 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 IFI44LQ53G44 452 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM64Q6YI46 380 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 SYT14Q8NB59 555 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRK-211ENST00000429595 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms