RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ENTPD8Q5MY95 495 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LIPJQ5W064 366 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CTRB2Q6GPI1 263 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TTC27Q6P3X3 843 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FAM122BQ7Z309 247 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CEACAM19Q7Z692 300 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf24Q7Z6I8 188 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC190Q86UF4 302 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf40Q8IXQ3 194 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D19Q8N5T2 526 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SYT14Q8NB59 555 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ACVR1CQ8NER5 493 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR10A6Q8NH74 314 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZIM3Q96PE6 472 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 UHRF2Q96PU4 802 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NAT9Q9BTE0 207 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FNDC11Q9BVV2 318 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GPR174Q9BXC1 333 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 IL1RAPQ9NPH3 570 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ASB6Q9NWX5 421 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CACFD1Q9UGQ2 172 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 POLR1DQ9Y2S0 133 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC22A23A1A5C7 686 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 KCNU1A8MYU2 1149 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 H3BN98 237 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC31A1O15431 190 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LAMTOR5O43504 91 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FOXS1O43638 330 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PIAS1O75925 651 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AP2A1O95782 977 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 JCHAINP01591 159 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RETP07949 1114 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FABP4P15090 132 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CNR1P21554 472 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 UGT2B10P36537 528 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OPRD1P41143 372 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR3A3P47888 321 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SULT1A2P50226 295 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HMGA2P52926 109 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5J2P56134 94 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ERVK-25P63136 954 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCDQ05655 676 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ARL16Q0P5N6 197 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC10A1Q14973 349 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 P2RY14Q15391 338 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 VMACQ2NL98 169 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TPRG1LQ5T0D9 272 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR4F3Q6IEY1 312 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR2A2Q6IF42 318 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ARCQ7LC44 396 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD37Q7Z713 158 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OOSP2Q86WS3 158 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PHYHIPQ92561 330 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RITA1Q96K30 269 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF670Q9BS34 389 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ELOVL6Q9H5J4 265 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AKIP1Q9NQ31 210 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TREX1Q9NSU2 369 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DDIT4Q9NX09 232 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EFCAB7A8K855 629 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 E7EQ34 232 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 E9PAM4 449 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TRAPPC3O43617 180 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 UGT1A9O60656 530 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GATBO75879 557 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT3O95989 172 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CST4P01036 141 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MT-ND4P03905 459 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNGP07510 517 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RBP1P09455 135 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NR2F6P10588 404 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms