RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF774Q6NX45 483 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF525Q8N782 197 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SLCO4A1Q96BD0 722 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 POM121L2Q96KW2 1035 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 DOK1Q99704 481 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SYT3Q9BQG1 590 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 DGCR6LQ9BY27 220 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf198Q9H425 327 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SPEF1Q9Y4P9 236 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 OR6C68A6NDL8 312 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 FKBP6O75344 327 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PTHP01270 115 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GAAP10253 952 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 BMP4P12644 408 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CCNOP22674 350 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 STOMP27105 288 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 NOS3P29474 1203 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 WNT5AP41221 380 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 PPOXP50336 477 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 CBX1P83916 185 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MEP1BQ16820 701 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 GLB1L2Q8IW92 636 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 OR6V1Q8N148 313 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 OR52L1Q8NGH7 329 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 OR1J2Q8NGS2 313 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf40Q8WZ69 217 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 SNX18Q96RF0 628 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D23Q9NUY8 699 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 ARMC1Q9NVT9 282 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 IL20Q9NYY1 176 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 B9D1Q9UPM9 204 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa12.84□□□□□ -0.35
CSAG1-201ENST00000361211 C5orf49A4QMS7 147 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf71A8MTZ7 269 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FAM171A2A8MVW0 826 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RNF223E7ERA6 249 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CLPTM1O96005 669 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RENP00797 406 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CENPAP49450 140 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EFNA4P52798 201 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PCBD1P61457 104 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RPS23P62266 143 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF101Q8IZC7 436 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CYB561A3Q8NBI2 242 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 NPEPL1Q8NDH3 523 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ICA1LQ8NDH6 482 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR52E2Q8NGJ4 325 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR4Q3Q8NH05 313 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GIPC3Q8TF64 312 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FEVQ99581 238 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TSSK6Q9BXA6 273 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LRMDAQ9H2I8 198 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZANQ9Y493 2812 aa12.83□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 VSTM5A8MXK1 200 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GNGT2O14610 69 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 IDH3BO43837 385 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DOK2O60496 412 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ATP5HO75947 161 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 LCKP06239 509 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ADRA2AP08913 450 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PCSK6P29122 969 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 CRABP1P29762 137 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH3B1P43353 468 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GDI2P50395 445 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RASSF2P50749 326 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 UCP2P55851 309 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 AQP6Q13520 282 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 GK3PQ14409 553 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DNM1P34Q6PK57 102 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 Q71RC1 249 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SYT9Q86SS6 491 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 BIVMQ86UB2 503 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 OR10H5Q8NGA6 315 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DDOQ99489 341 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 REG4Q9BYZ8 158 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 TPK1Q9H3S4 243 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 DYNLRB1Q9NP97 96 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ASH2LQ9UBL3 628 aa12.82□□□□□ -0.36
CSAG1-201ENST00000361211 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms