RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 C6P13671 934 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ELNP15502 786 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 GSK3AP49840 483 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 BTN3A2P78410 334 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 TEX30Q5JUR7 227 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ZAR1Q86SH2 424 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 COX18Q8N8Q8 333 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 MCHR2Q969V1 340 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 MEGF10Q96KG7 1140 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC17A9Q9BYT1 436 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 OPA3Q9H6K4 179 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 CCL26Q9Y258 94 aa19.2■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 FITM1A5D6W6 292 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 TMEM235A6NFC5 223 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 M0R036 132 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 CCKBRP32239 447 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 KCNG2Q9UJ96 466 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 KPTNQ9Y664 436 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 NUP210LQ5VU65 1888 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 IFITM10A6NMD0 228 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ID2Q02363 134 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 MOGAT2Q3SYC2 334 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 PRSS35Q8N3Z0 413 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 MRGPRX3Q96LB0 322 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 NRSN2Q9GZP1 204 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 XIRP2A4UGR9 3374 aa19.19■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ACTR1BP42025 376 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC41A2Q96JW4 573 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 DCAF16Q9NXF7 216 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 LRRK1Q38SD2 2015 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 OR8U9P0C7N5 309 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 NDUFB7P17568 137 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC7A9P82251 487 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 BTNL8Q6UX41 500 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC16A9Q7RTY1 509 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ZNF584Q8IVC4 421 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC43A2Q8N370 569 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 OR8U1Q8NH10 309 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 PRRT1Q99946 306 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC17A5Q9NRA2 495 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 OR5AC2Q9NZP5 309 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SCN5AQ14524 2016 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC6A9P48067 706 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 NPAS4Q8IUM7 802 aa19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 OBSL1O75147 1896 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SCN2AQ99250 2005 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 TACR3P29371 465 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ASPHD2Q6ICH7 369 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 FRMD1Q8N878 549 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 MESP1Q9BRJ9 268 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 TUBA4BQ9H853 241 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PRU2 124 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 URADA6NGE7 173 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 STK17BO94768 372 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 EMDP50402 254 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 DMWDQ09019 674 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 PMPCAQ10713 525 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLC22A6Q4U2R8 563 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ZNF563Q8TA94 476 aa19.17■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PPE2 198 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 CXorf65A6NEN9 183 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 TMEM212A6NML5 194 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ZNF432O94892 652 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 FGF19O95750 216 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 IFNA2P01563 188 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 LSSP48449 732 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 NMES1Q9C002 83 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 PRDM13Q9H4Q3 707 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 CAPN10Q9HC96 672 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ARGFXA6NJG6 315 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 EFSO43281 561 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 CFPP27918 469 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 KIR3DL2P43630 455 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 TM4SF4P48230 202 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 FAM166AQ6J272 317 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 GVQW1Q8N7I0 195 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 AKR7LQ8NHP1 331 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 ASB17Q8WXJ9 295 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 RGCCQ9H4X1 137 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 LAMP5Q9UJQ1 280 aa19.16■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 DBX1A6NMT0 343 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 DCTN6O00399 190 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 MEF2DQ14814 521 aa19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 EBPQ15125 230 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ODC1-201ENST00000234111 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms