RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617875.4

RECQL4-209, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RECQL4, Length 3,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-209ENST00000617875 RADILQ96JH8 1075 aa14.52□□□□□ -0.08
RECQL4-209ENST00000617875 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RECQL4-209ENST00000617875 B9D1Q9UPM9 204 aa14.52□□□□□ -0.08
RECQL4-209ENST00000617875 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RECQL4-209ENST00000617875 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 K7EQS6 105 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 MMP15P51511 669 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 FXYD4P59646 89 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 GLO1Q04760 184 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 GIMAP5Q96F15 307 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 A0A1W2PNR3 127 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PLPP2O43688 288 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PMP2P02689 132 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 RRASP10301 218 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 CMIPQ8IY22 773 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM156Q8N614 296 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PRR13Q9NZ81 148 aa14.52□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 CAPZA1P52907 286 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 CHST6Q9GZX3 395 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 A0A0G2JNG1 304 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 H0YIG0 161 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 EPHA4P54764 986 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 KIR2DS5Q14953 304 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 MLC1Q15049 377 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF75AQ96N20 296 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PNMTP11086 282 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 AVPR2P30518 371 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SLC36A2Q495M3 483 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TMED6Q8WW62 240 aa14.51□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 AIPO00170 330 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TXNL1O43396 289 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 GPRIN2O60269 458 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 CXCL2P19875 107 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 EFNB2P52799 333 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 HNF4GQ14541 408 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 KCNJ13O60928 360 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ACTBP60709 375 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ACTG1P63261 375 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 A0A0A6YYH2 397 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 A6NJ64 397 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 CSF1P09603 554 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 AMY2BP19961 511 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 HTR2CP28335 458 aa14.5□□□□□ -0.09
RECQL4-209ENST00000617875 NPY4RP50391 375 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms