RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 OR52N1Q8NH53 320 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD4Q8TB40 342 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 BOCQ9BWV1 1114 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR52D1Q9H346 318 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF90Q03938 601 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1FQ16864 119 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RANBP10Q6VN20 620 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM206AQ9NX38 181 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CSO75390 466 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HAND1O96004 215 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 KIR2DS2P43631 304 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR1Q1Q15612 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PLK3Q9H4B4 646 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 EMCNQ9ULC0 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HSBP1O75506 76 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FUCA1P04066 466 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CSF3P09919 207 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SHHQ15465 462 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR4F5Q8NH21 305 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR4F4Q96R69 305 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 F5P12259 2224 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 LMAN2Q12907 356 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 IL24Q13007 206 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FA2HQ7L5A8 372 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MMP21Q8N119 569 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR1L3Q8NH93 324 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB118Q96PH6 123 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MENTQ9BUN1 341 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 WDR76Q9H967 626 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM227AF5H4B4 570 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF17P17021 662 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PSMB2P49721 201 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 DAPP51397 102 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ARSDP51689 593 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SHC2P98077 582 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GALMQ96C23 342 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HES4Q9HCC6 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CHRM2P08172 466 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GDI1P31150 447 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PSMB10P40306 273 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MBTPS1Q14703 1052 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35B4Q969S0 331 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CAPNS2Q96L46 248 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0B4J203 849 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 C7orf72A4D263 438 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TNFSF12O43508 249 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 IDUAP35475 653 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GJC3Q8NFK1 279 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ASB11Q8WXH4 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 RAB24Q969Q5 203 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SOCS7O14512 581 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 MGMTP16455 207 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 VIPR2P41587 438 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 VASH2Q86V25 355 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-209ENST00000612229 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms