RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 TCTAP57738 103 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SERTAD2Q14140 314 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF345Q14585 488 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PEX11GQ96HA9 241 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR7D2Q96RA2 312 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 LMF1Q96S06 567 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MOKQ9UQ07 419 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GCGP01275 180 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 IDSP22304 550 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GRPRP30550 384 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NHLH2Q02577 135 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KCNAB1Q14722 419 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 LTB4RQ15722 352 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CST6Q15828 149 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RPE65Q16518 533 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR9A2Q8NGT5 310 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FGF13Q92913 245 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 V9GY05 133 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 H3BQ06 376 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MAN2B1O00754 1011 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 EPHX1P07099 455 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 INHBBP09529 407 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 IFI6P09912 130 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR5H8P0DN80 308 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HSD11B2P80365 405 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 METRNLQ641Q3 311 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SYS1Q8N2H4 156 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MITD1Q8WV92 249 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM3CQ92520 227 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM131CQ96AQ9 280 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM100Q9NV29 134 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 H0Y8G0 127 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KNG1P01042 644 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 A0A087WV62 115 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C7orf66A4D0T2 115 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 VSTM5A8MXK1 200 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SEMG1P04279 462 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MMP15P51511 669 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CAV2P51636 162 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TLE1Q04724 770 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 PRRC1Q96M27 445 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 DPH7Q9BTV6 452 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRD-214ENST00000540109 GPR37O15354 613 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C6orf47O95873 294 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SOD1P00441 154 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OPN1LWP04000 364 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO45P0C2W1 286 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GJA4P35212 333 aa5.55□□□□□ -1.52
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