RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	NEK6	Q9HC98	313 aa		2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	PRO0461	Q9UI25	63 aa		2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	PSG11	Q9UQ72	335 aa		2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	PSG8	Q9UQ74	426 aa		2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	NSD2	O96028	1365 aa		2.56	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SGK1	O00141	431 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	GABARAP	O95166	117 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	AGT	P01019	485 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RRM2	P31350	389 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CEACAM6	P40199	344 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RND2	P52198	227 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	MAB21L1	Q13394	359 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	EBI3	Q14213	229 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ABHD13	Q7L211	337 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	LHX9	Q9NQ69	397 aa		2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454		A0A075B6Q4	140 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CDH16	O75309	829 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ENTPD5	O75356	428 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SPAG7	O75391	227 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	H6PD	O95479	791 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RAB3D	O95716	219 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	KRT14	P02533	472 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	DCK	P27707	260 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	FOXN2	P32314	431 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC1A1	P43005	524 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SYK	P43405	635 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF138	P52744	262 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	PRRX1	P54821	245 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SLA	Q13239	276 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF691	Q5VV52	312 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	C22orf42	Q6IC83	251 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	IQCK	Q8N0W5	287 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CHP1	Q99653	195 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RAB20	Q9NX57	234 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	MYO10	Q9HD67	2058 aa		2.54	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SIRPB1	O00241	398 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CHST1	O43916	411 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	KLHL41	O60662	606 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	IGKV3-11	P04433	115 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	OR5H8	P0DN80	308 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CRISP1	P54107	249 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	C21orf59	P57076	290 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RAB10	P61026	200 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	TCP10	Q12799	353 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	ERCC8	Q13216	396 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	GINS1	Q14691	196 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	RGN	Q15493	299 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	PLET1	Q6UQ28	207 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	STARD4	Q96DR4	205 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	OR2A5	Q96R48	311 aa		2.53	□□□□□ -2
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		2.53	□□□□□ -2

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