RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 CGREF1Q99674 301 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 NANOGQ9H9S0 305 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 INIPQ9NRY2 104 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 GMEB1Q9Y692 573 aa9.48□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PRG6 482 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 LAP3P28838 519 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 OR1E2P47887 323 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 GZMMP51124 257 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 CD47Q08722 323 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 MICU2Q8IYU8 434 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 TIMD4Q96H15 378 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 SIAEQ9HAT2 523 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.47□□□□□ -0.89
ACTB-209ENST00000473257 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.47□□□□□ -0.89
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ACTB-209ENST00000473257 J3QLI3 93 aa9.46□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.95e-7■■■■□ 22.6
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ACTB-209ENST00000473257 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.46□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 RABL3Q5HYI8 236 aa9.46□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 C10orf128Q5T292 105 aa9.46□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 CROCCP2Q86T23 111 aa9.46□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.46□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 C1orf198Q9H425 327 aa9.46□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPL8 197 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 PLSCR5A0PG75 271 aa9.45□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 IGHV2-70P01814 119 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 MT-ND5P03915 603 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ATP4BP51164 291 aa9.45□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 TAS2R41P59536 307 aa9.45□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 PCDHAC1Q9H158 963 aa9.45□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.45□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 FBP2O00757 339 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ANGPT2O15123 496 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ENTPD5O75356 428 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 GPANK1O95872 356 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 HKR1P10072 659 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 OMGP23515 440 aa9.44□□□□□ -0.9
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