RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472768.5

GPSM3-208, Transcript of G protein signaling modulator 3, human

TSL 2

Gene GPSM3, Length 1,417 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPSM3-208	ENST00000472768	TNFRSF1A	P19438	455 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	PCBD1	P61457	104 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	CD47	Q08722	323 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	BAMBI	Q13145	260 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	SGCA	Q16586	387 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	ABHD4	Q8TB40	342 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	ASB10	Q8WXI3	467 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	ZBTB9	Q96C00	473 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	C7orf26	Q96N11	449 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	IGHM	P01871	453 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	MT-ND1	P03886	318 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	CD55	P08174	381 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	SBK2	P0C263	348 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF32	P17041	273 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	GSTM3	P21266	225 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	MTNR1A	P48039	350 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	UGT2B15	P54855	530 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	TAF11	Q15544	211 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	SEPHS2	Q99611	448 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
GPSM3-208	ENST00000472768	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	SURF4	O15260	269 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	FUT1	P19526	365 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TUBG1	P23258	451 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	MPV17	P39210	176 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	PPP1CB	P62140	327 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	MTX3	Q5HYI7	312 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TREML4	Q6UXN2	200 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	SGTB	Q96EQ0	304 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	RBP7	Q96R05	134 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	RAB21	Q9UL25	225 aa		15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ANGPT2	O15123	496 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	OR7A10	O76100	309 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	SLC2A10	O95528	541 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	IGF2	P01344	180 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	WNT5A	P41221	380 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	IDH3A	P50213	366 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TAS2R41	P59536	307 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF154	Q13106	437 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ESCO2	Q56NI9	601 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	PTOV1	Q86YD1	416 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	NANOG	Q9H9S0	305 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		15.38	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	LYPD3	O95274	346 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	IGHV2-70	P01814	119 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF12	P17014	697 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	CDA	P32320	146 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	AQP2	P41181	271 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ERVK-25	P63136	954 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	FAM27B	Q5VT28	67 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	NSMAF	Q92636	917 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	LRRC58	Q96CX6	371 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	SAMD8	Q96LT4	415 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ALG12	Q9BV10	488 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		15.37	■□□□□ 0.05
GPSM3-208	ENST00000472768	ZNF69	Q9UC07	566 aa		15.37	■□□□□ 0.05

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