RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 C5orf46Q6UWT4 87 aa16.48■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.48■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.48■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 STK35Q8TDR2 534 aa16.48■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf44Q96CB5 159 aa16.48■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.48■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SLC17A5Q9NRA2 495 aa16.48■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 L7N2F9 121 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 MEN1O00255 615 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SNAPC5O75971 98 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OPCMLQ14982 345 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR52N5Q8NH56 324 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ASB5Q8WWX0 329 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM234Q8WY98 164 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF576Q9H609 170 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CA14Q9ULX7 337 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 RP1P56715 2156 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CIB4A0PJX0 185 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 TTLL8A6PVC2 850 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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SYNE4-204ENST00000465425 OR2A4O95047 310 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 IGHMP01871 453 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC26A5P58743 744 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 KDM8Q8N371 416 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR1J4Q8NGS1 313 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR8S1Q8NH09 359 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SUN5Q8TC36 379 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 OR2A7Q96R45 310 aa16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 I3L521 148 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 FCER2P06734 321 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF823P16415 610 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 HTR2CP28335 458 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CSF2RBP32927 897 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ACTBP60709 375 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 ACTG1P63261 375 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CFHR1Q03591 330 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 MDGA2Q7Z553 956 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 COMMD7Q86VX2 200 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CATSPERDQ86XM0 798 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 TAS2R4Q9NYW5 299 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 PLSCR5A0PG75 271 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CD3DP04234 171 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 VSIG10L2P0DP72 767 aa16.46■□□□□ 0.23
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SYNE4-204ENST00000465425 FAM209AQ5JX71 171 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 MISPQ8IVT2 679 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 MARVELD3Q96A59 401 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 GSX2Q9BZM3 304 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 FGF21Q9NSA1 209 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 CTSFQ9UBX1 484 aa16.46■□□□□ 0.23
SYNE4-204ENST00000465425 SPEGQ15772 3267 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 OR2M5A3KFT3 312 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 MPZL1O95297 269 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 PDGFAP04085 211 aa16.45■□□□□ 0.22
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SYNE4-204ENST00000465425 DNASE1L1P49184 302 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 NHLRC1Q6VVB1 395 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 OR13C3Q8NGS6 347 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 EMC9Q9Y3B6 208 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 WNT11O96014 354 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 HRGP04196 525 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 TOMM20Q15388 145 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 FAM166AQ6J272 317 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 STEAP1BQ6NZ63 245 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF627Q7L945 461 aa16.45■□□□□ 0.22
SYNE4-204ENST00000465425 BIVMQ86UB2 503 aa16.45■□□□□ 0.22
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