RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ACOD1A6NK06 481 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM212A6NML5 194 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 AIPO00170 330 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MASP2O00187 686 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD9O00233 223 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 XKRYO14609 159 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GPR171O14626 319 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CTDSPLO15194 276 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DNPH1O43598 174 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 LANCL1O43813 399 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SLC43A1O75387 559 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TPPPO94811 219 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF432O94892 652 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MPZL1O95297 269 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PMS2P2O95744 297 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PAHP00439 452 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ISG15P05161 165 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 KRT8P05787 483 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ADRB1P08588 477 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SRMP19623 302 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 FSTP19883 344 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MYL9P24844 172 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DCTDP32321 178 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RPS27P42677 84 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 NR4A2P43354 598 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DL3P43628 341 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SSR4P51571 173 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN6P56747 220 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SCAND1P57086 179 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DEFA1P59665 94 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DEFA3P59666 94 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H3AP68431 136 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TLE3Q04726 772 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SCN1BQ07699 218 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 FOXO1Q12778 655 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MEP1BQ16820 701 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SLC36A2Q495M3 483 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 IDNKQ5T6J7 187 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 AGAP6Q5VW22 663 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF529Q6P280 563 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SPATC1Q76KD6 591 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MDGA2Q7Z553 956 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 GLRX5Q86SX6 157 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 BIVMQ86UB2 503 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM123Q8N131 208 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 KDM8Q8N371 416 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR52N5Q8NH56 324 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR6X1Q8NH79 312 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HTRA1Q92743 480 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 YIPF5Q969M3 257 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ORAI1Q96D31 301 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRG7Q96K78 797 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SGCZQ96LD1 299 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CEP19Q96LK0 163 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 AGAP4Q96P64 663 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ABCG5Q9H222 651 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 MED29Q9NX70 200 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PADI1Q9ULC6 663 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms