RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PSME2Q9UL46 239 aa3.3□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 DSPPQ9NZW4 1301 aa3.29□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.29□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF716A6NP11 495 aa3.29□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 SULT2B1O00204 365 aa3.29□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 EFNA2O43921 213 aa3.29□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NME6O75414 186 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.29□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 STK16O75716 305 aa3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFB4O95168 129 aa3.28□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
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ECHDC1-211ENST00000460558 CDKN2DP55273 166 aa3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 FGF12P61328 243 aa3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 GALK2Q01415 458 aa3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 MYL5Q02045 173 aa3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 PAX2Q02962 417 aa3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 CUL3Q13618 768 aa3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
ECHDC1-211ENST00000460558 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.28□□□□□ -1.88
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