RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 TESCQ96BS2 214 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC115Q96NT0 180 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 FMO2Q99518 471 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ASPNQ9BXN1 380 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.51□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC154A6NI56 674 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 TOX4O94842 621 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 FSTL3O95633 263 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PGA4P0DJD7 388 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PGA3P0DJD8 388 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 TNFSF4P23510 183 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 HTR2AP28223 471 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CDKN2CP42773 168 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 EFNB2P52799 333 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 HSF2Q03933 536 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 COX10Q12887 443 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 HIST3H3Q16695 136 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF404Q494X3 552 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 C8orf74Q6P047 294 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CNPY4Q8N129 248 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 OR8B3Q8NGG8 313 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ABHD4Q8TB40 342 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 SLC35B4Q969S0 331 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF566Q969W8 418 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 OR2V2Q96R30 315 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 OR8B2Q96RD0 313 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CLN8Q9UBY8 286 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.5□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 C11orf98E9PRG8 122 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PHYHO14832 338 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF32P17041 273 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 SLC6A2P23975 617 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 GABRA5P31644 462 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CRISP3P54108 245 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 LYG1Q8N1E2 194 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 MCHR2Q969V1 340 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 TEX37Q96LM6 180 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 WDFY2Q96P53 400 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF607Q96SK3 696 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 MMP28Q9H239 520 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CALML5Q9NZT1 146 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.49□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 IFNL4K9M1U5 179 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 RIPK2O43353 540 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 BCHEP06276 602 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ADORA3P0DMS8 318 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 KITLGP21583 273 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 EPHA3P29320 983 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ALDH3A1P30838 453 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 GDI2P50395 445 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PSG4Q00888 419 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 CD69Q07108 199 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 MELKQ14680 651 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 FAM201AQ5SY85 155 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PTOV1Q86YD1 416 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 OR5J2Q8NH18 312 aa9.48□□□□□ -0.89
DDX39B-209ENST00000428450 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms